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南投草屯朝清宮的媽祖，並非從大陸渡海來台，也不是從哪間大廟分靈，而是由草屯仕紳林清南先生從清水鎮恭迎聖母金尊回宅中奉祀的。
話說林先生的媳婦當時身染重病，遍訪名醫都束手無策，心急如焚的林先生只好求助於神明，到清水鎮恭請媽祖娘娘來家中醫治。說也神奇，媽祖娘娘一來，媳婦的病竟然就好了！林家人對媽祖娘娘感激不已，便懇求媽祖娘娘留在草屯，庇佑全家。媽祖娘娘慈悲為懷，答應了林家的請求，並指示在三樓供奉聖母金身。
自此之後，林家早晚焚香奉敬，鄰居信眾也紛紛前來參拜，香火日益鼎盛。民國六十五年（1976年），媽祖指示要另覓更寬敞的地方供奉，於是便遷移到炎峰街，並正式命名為「朝清宮」。民國六十九年(1980年)，朝清宮在現址建廟，讓媽祖娘娘有了屬於自己的宮殿。
朝清宮的媽祖娘娘非常靈驗，不僅庇佑著草屯的居民，也吸引了許多外地的信眾前來參拜。朝清宮也積極參與地方的事務，例如舉辦慈善活動、文化推廣等等，是草屯地區重要的信仰和活動中心。
來到朝清宮，除了參拜媽祖娘娘，也可以欣賞廟裡的建築和藝術之美。朝清宮的建築宏偉壯觀，雕樑畫棟，金碧輝煌，尤其是那尊高達12.5公尺的世界最大金媽祖神像，更是令人嘆為觀止。
